水環真空泵在使用的過程中會因為水質的原因出現結垢現象，這是一種經常出現的問題，這類現象的出現很有可能會導致設備運轉故障不穩定等現象。出現結垢后要定期處理，一般是每月去除一次，要通過運用合理的除垢方法，不損壞設備的主要組件，采用加入阻垢劑之類的產品對其進行去除，清除時可用工業鍋爐用的去垢劑，從水環泵排氣口內倒入，泵內放滿水浸泡約20分鐘，利用放水螺塞放盡水環真空泵體內的水，再啟動水環真空泵并通水運轉幾分鐘洗滌、排出水垢。也可以利用一些酸性物質進行，但其含量的比例要掌握好，否則會給設備帶來不利的因素，盡量在使用水介質時，采用比較好的，含雜質及其他物質少的水源，這樣會有效地控制結垢現象的出現。
以正確的方法對水環真空泵進行結垢處理，對于設備的使用壽命是非常有好處的，其主要的應用也是便于整套設備使用的，做到先預防的措施，盡量避免這類現象給設備造成的影響。
